MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. WCH70 plasmid pWCH7002

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012790	T	6	6	10	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012790	TAT	2	6	2221	2226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012790	TAA	2	6	2227	2232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012790	ATA	2	6	2233	2238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012790	T	6	6	2276	2281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012790	TAT	2	6	2321	2326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012790	TAA	2	6	2327	2332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012790	ATA	2	6	2333	2338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012790	T	6	6	2376	2381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012790	TAT	2	6	2421	2426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012790	TAA	2	6	2427	2432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012790	ATA	2	6	2433	2438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012790	T	6	6	2476	2481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012790	TAT	2	6	2521	2526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012790	TAA	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012790	ATA	2	6	2533	2538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012790	T	6	6	2576	2581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012790	TAT	2	6	2621	2626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012790	TAA	2	6	2627	2632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012790	ATA	2	6	2633	2638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012790	T	6	6	2676	2681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012790	TAT	2	6	2721	2726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012790	TAA	2	6	2727	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012790	ATA	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012790	T	6	6	2786	2791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012790	TTG	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012790	CT	4	8	2834	2841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012790	A	6	6	4035	4040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012790	TC	3	6	4047	4052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012790	T	7	7	4078	4084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012790	GTT	2	6	4094	4099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012790	T	6	6	4920	4925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012790	TTG	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012790	T	6	6	4997	5002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012790	TTC	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012790	TAAAAA	2	12	5042	5053	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012790	AAG	3	9	5074	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012790	TTC	3	9	5088	5096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012790	AGA	2	6	5322	5327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012790	AATG	2	8	5329	5336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012790	T	7	7	5351	5357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012790	TCA	2	6	5364	5369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012790	ATTTT	2	10	5402	5411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012790	T	6	6	5408	5413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012790	T	6	6	5473	5478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012790	T	6	6	5480	5485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012790	T	6	6	5506	5511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012790	T	7	7	5513	5519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012790	CT	3	6	5541	5546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012790	T	7	7	5546	5552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012790	T	8	8	5570	5577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012790	TAT	2	6	5628	5633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012790	TAA	2	6	5634	5639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012790	ATA	2	6	5640	5645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012790	T	6	6	5683	5688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012790	TTTG	2	8	5691	5698	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012790	TGG	2	6	5712	5717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012790	G	6	6	5716	5721	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012790	TC	3	6	5727	5732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012790	GGA	2	6	5740	5745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012790	T	6	6	5771	5776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012790	GAA	2	6	5787	5792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012790	AGG	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012790	T	6	6	6234	6239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012790	T	6	6	6241	6246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012790	T	6	6	6267	6272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012790	T	7	7	6274	6280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012790	CT	3	6	6302	6307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012790	T	7	7	6307	6313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012790	T	8	8	6331	6338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012790	A	8	8	6378	6385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012790	T	6	6	6391	6396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012790	CAC	2	6	6397	6402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_012790	ATA	2	6	6424	6429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012790	GAAG	2	8	6509	6516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012790	A	7	7	6552	6558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012790	AGG	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012790	TTCTG	2	10	6596	6605	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012790	TGG	2	6	6648	6653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012790	ACC	2	6	6660	6665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_012790	T	6	6	6749	6754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012790	GGTG	2	8	6790	6797	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012790	GGA	2	6	6845	6850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012790	GCG	2	6	7040	7045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012790	GGCG	2	8	7135	7142	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012790	GCGTA	2	10	7190	7199	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012790	CA	3	6	7270	7275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012790	TCG	2	6	7306	7311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012790	A	6	6	7489	7494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012790	TTG	2	6	8374	8379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012790	T	6	6	8392	8397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012790	TTC	2	6	8401	8406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012790	TAAAAA	2	12	8437	8448	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012790	AAG	3	9	8469	8477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012790	TTC	3	9	8483	8491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012790	A	6	6	8726	8731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012790	T	6	6	8747	8752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012790	AC	3	6	8779	8784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012790	T	6	6	8845	8850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012790	AT	3	6	8883	8888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012790	AAAGAA	2	12	8969	8980	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012790	A	6	6	9024	9029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012790	AC	3	6	9044	9049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012790	A	7	7	9051	9057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012790	AG	3	6	9100	9105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012790	A	6	6	9571	9576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012790	T	8	8	9592	9599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012790	T	8	8	9601	9608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012790	ATA	2	6	9614	9619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012790	TA	3	6	9625	9630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012790	AATAA	2	10	9647	9656	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012790	GGT	2	6	9658	9663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.